Com a implantação da República cessou o culto na Capela, tendo a Irmandade dos Carpinteiros de Machado subsistido como Associação de Socorros Mútuos, passando em 1913 a designar-se “Irmandade de São Roque dos Carpinteiros Navais”, para em 1928 ser extinta pela Autoridade Civil, sendo os seus bens leiloados.

A Autoridade Religiosa manteve viva a Irmandade e a Capela reabriu ao culto em 1955, tendo sido recuperados alguns dos seus pertences, designadamente uma Cruz do século XVIII, Santo Cristo de metal dourado engastado em madrepérola, duas murças pretas e um pano de porta, encarnado, com as armas da Irmandade.

Em 1990 a primitiva Irmandade de São Roque sediada ainda hoje na sua Capela, na Igreja de São Roque, passa a ser designada por Irmandade da Misericórdia e de São Roque de Lisboa (IMSRL), competindo-lhe, por Decreto-Lei, a tutela do espírito cristão que enfoca a acção da SCML.

Em 2011 a Irmandade de São Roque dos Carpinteiros de Machado, por fusão, foi integrada na IMSRL, instituição de que se havia separado pela dissidência referida, em 1570.

Já em 2018, São Roque dos Carpinteiros de Machado é designado Padroeiro da Real Associação Humanitária dos Bombeiros Voluntários de Lisboa, evocando a histórica intervenção dos membros da Confraria de São Roque no combate aos incêndios na cidade de Lisboa.

Esta Capela de São Roque data de 1761 e foi construída pela Irmandade dos Carpinteiros de Machado, para substituir as suas anteriores instalações no convento do Carmo, destruídas pelo terramoto de 1755. Começou por ser uma construção provisória de madeira (1756 a 1761) para passar a este monumental edifício de pedra e cal, que foi sendo embelezado ao longo dos anos conforme as disponibilidades da Irmandade. Faz conjunto com a Capela a sacristia e no andar superior a Casa do Despacho da Irmandade.

A Irmandade dos Carpinteiros de Machado foi constituída em 1570, por Irmãos da Real Irmandade do Glorioso São Roque dos Carpinteiros de Machado que discordaram da cedência da Ermida, dedicada a São Roque, que havia sido construída em 1506 por 70 homens bons da Cidade de Lisboa, constituídos em Real Irmandade do Glorioso São Roque e da qual os Carpinteiros de Machado faziam parte, destinando-se a mesma a acolher as relíquias do Santo.

As relíquias foram pedidas a Veneza pelo rei D. Manuel e acolhidas em Portugal com grande júbilo e esperança da salvação da peste que afligia Lisboa e todo o reino. Para permitir a construção da que viria a ser a magnifica Igreja de São Roque, a primeira igreja dos jesuítas e ao seu lado a sua Casa Professa, seminário e universidade, o Rei impôs à Irmandade de São Roque a cedência da Ermida aos primeiros padres da Companhia de Jesus chegados a Portugal, o que originaria a já referida fractura da Real Irmandade do Glorioso São Roque dos Carpinteiros de Machado.

No altar-mor da Capela, dominando o espaço, um belo retábulo a óleo sobre tela, de meados do século XVIII, atribuído a José da Costa Negreiros, representa o Santo num bosque, onde é visitado por um cão que lhe leva diariamente o pão que recolhe da mesa do seu dono. A imagem de São Roque é de madeira policromada, também do século XVIII.

Os estuques são de Mestre João Grossi (1769). Nos estuques do tecto, em abóbada, juntam-se ornamentos em relevo.

O coro e púlpito, de madeira pintada, foram adicionados em 1777. Sobre a janela do coro alto, está um fresco representando as armas da “Irmandade dos Carpinteiros Navais”

Os painéis de azulejos do século XVIII, provavelmente da fábrica do Rato, representam momentos da vida do Santo (nascimento, sendo visível a cruz vermelha que o marcaria e que viria a ser o elemento de identificação para o tio que o recolhe já morto na prisão; visita a um hospital, em que fez maravilhas; sinal da cruz na testa de um cardeal, em Roma, que enfermo ficou curado; eremita no bosque onde o cão lhe leva o pão; na prisão em Montpellier, onde o tio o reconhece).

As pinturas a fresco (1836) nas paredes laterais representam os 4 evangelistas, com os símbolos que os identificam. Na parede direita S. Mateus (anjo) e São Lucas (touro) tendo por baixo alegorias com os dísticos Religião e Constância. Na parede esquerda São João Evangelista (águia) e São Marcos (leão) tendo por baixo os dísticos Amor de Deus e Caridade.

Completam a decoração figuras de madeira de Alexandre Giusti e colaboração de Machado de Castro. No lado direito do altar está figurada a Fé, segurando um cálice e uma cruz, e do lado esquerdo a Esperança, segurando uma âncora, ao meio o Cordeiro encimado por uma coroa e mais acima a triangulação simbólica da Santíssima Trindade.

Junto à Igreja fica a sacristia, tendo no meio do tecto pintadas as armas da Irmandade. A ligação da sacristia ao coro alto teve lugar em 1863.

No exterior, adossado à porta, está o sino da Capela, que tem gravada a inscrição “Feito no Arsenal da Marinha no ano de 1822”.

Em 2016 a Capela sofreu substanciais obras de restauro geral, com o apoio do Fundo Rainha D. Leonor, da Santa Casa da Misericórdia de Lisboa (SCML).

A Irmandade dos Carpinteiros de Machado, seja embora pelos caminhos menos felizes da dissidência, é filha da Real Irmandade do Glorioso São Roque, ambas se dedicando ao culto do seu patrono e à protecção, apoio e ajuda das viúvas e órfãos resultantes de guerras e naufrágios, com destaque para o resgate dos marinheiros e outros que eram feitos reféns nas muitas guerras em que se viam envolvidos.